Baka to Test to Shoukanjuu

L'histoire se centre sur Akihisa Yoshii, l'abruti de service. L'établissement dans lequel il étudie est quelque peu particulier, en effet, il classe les différents élèves par classe en se basant sur les résultats d'examen. Les élèves les plus intelligents se retrouvent donc en classe A, tandis que les plus bêtes se retrouvent en classe F. Évidemment, la classe A bénéficie de privilèges tels que la climatisation, un écran plasma, etc. Tandis que la classe F ne bénéficie d'aucun confort, leurs tables ne sont que de simples tables basses décrépites et leurs chaises, des tatamis usés de paille. De plus, il est possible d'obtenir des notes, lors de combats virtuels avec des créatures fantastiques mises au point par l'établissement, c'est ainsi que se déroulent les examens. Mizuki Himeji, une fille ayant comme potentiel d'être la seconde élève au rang de l'école, se retrouve pourtant reléguée à la classe F après avoir dû s'absenter des examens pour cause de forte fièvre. Il y a aussi Yuji Sakamoto, le meilleur ami et compagnon de bêtise de Akihisa, depuis son enfance. Avec eux, Akihisa décide de battre les élèves de la classe A grâce au système de combat virtuel, et de leur prendre leurs privilèges...